cap

Ответ от Јика[гуру]
Кэп (5' кэп, кэп-структура) (от англ. cap — шапочка) — один или несколько модифицированных нуклеотидов на 5'-конце транскриптов, синтезированных РНК-полимеразой II. С химической точки зрения, кэп представляет собой 7-метилгуанозин, соединённый 5',5'-трифосфатным мостиком с первым нуклеотидным остатком транскрипта. В узком смысле под кэпом понимают именно 7-метилгуанозин. Кроме того, первые два нуклеотида транскрипта могут метилироваться по 2'-O положению рибозы. Кэп способствует эффективному процессингу пре-мРНК, экспорту мРНК из ядра, её трансляции и защите от быстрой деградации.
У подавляющего большинства эукариот 5'-конец транскриптов, синтезируемых РНК-полимеразой II, ко-транскрипционно модифицируется путём присоединения 7-метилгуанозина, или кэпа (см. рисунок) . РНК-полимераза II синтезирует все пре-мРНК, некоторые малые ядерные РНК и малые ядрышковые РНК. Вирусы, которые приспособлены к жизни в эукариотических клетках, также могут иметь кэпированные РНК независимо от того, синтезируются ли они РНК-полимеразой II или другим ферментом. В зависимости от типа организма и типа РНК первоначальная кэп-структура может подвергаться дальнейшим модификациям, главным образом, метилированию.
Выделяют следующие типы кэпа:
кэп 0 (m7GpppNp, где N — любой нуклеотид) — это минимальная кэпирующая структура, которая представляет собой 7-метилгуанозин, соединённый 5',5'-трифосфатным мостиком с первым нуклеотидом РНК [2]. Кэп 0 распознаётся фактором инициации трансляции eIF4E[5];
кэп 1 (m7GpppNm2'-Op) отличается от кэпа 0 метилированием первого нуклеотида транскрипта по 2'-O положению рибозы;
кэп 2 (m7GpppNm2'-OpNm2'-Op) отличается от кэпа 0 метилированием первого и второго нуклеотидов транскрипта по 2'-O положению рибозы;
кэп 4 (m7GpppNm2'-OpNm2'-OpNm2'-OpNm2'-Op);
2,2,7-триметилгуанозиновый кэп (m2,2,7GpppNp)
Кэп 0 характерен для РНК растений (а также вирусов растений) и грибов, у животных он встречается редко. Для РНК животных характерны кэп 1 и кэп 2, соотношение которых в клетке зависит от вида организма. Вирусы животных также, как правило используют кэп 1 или кэп 2. Интересно, что в РНК вирусов животных первым нуклеотидом после 7-метилгуанозина обычно является пурин, который может быть дополнительно метилирован по атомам азотистого основания (например, с образованием N6-метиладенозина) . В клеточных же мРНК первым нуклеотидом после кэпа может быть любой из четырёх, и он тоже, как правило, дополнительно метилирован. В целом можно сказать, что чем более высоко организован организм, тем больше метильных групп содержится в его кэп-структурах [2]. Кэп 4 был обнаружен у некоторых простейших. 2,2,7-триметилгуанозиновый кэп характерен для малых ядерных РНК и служит сигналом к их транспорту и/или удержанию в ядре
Подробно в источнике
кэп: Капиан очевидность. Персонаж из мультсериала "Южный Парк". Например: -У нас горит здание что делать? -Надо было поставить пожарную лесницу к верхним этажам, укрепить крышу, чтобы мог садиться вертолет и не надо было строить рядом здание, теперь там не могут припарковаться пожарные машины! -Спасибо, Капитан Очевидность!