openmpi

Ответ от Stefa oshekov[мастер]
Для установки линукс-кластера вам потребуется установочный диск Linux, с помощью которого вы установить операционную систему на консоль (главный компьютер) кластера. С того же самого диска нужно будет установить операционную систему на вычислительные узлы кластера. Однако, если вычислительные узлы не предполагается использовать в качестве офисных машин, но только как узлы кластера, то на эти компьютеры правильнее будет установить серверную редакцию дистрибутива - Ubuntu Server Edition, не содержащую графического интерфейса, и соответственно более легкую и быструю.
Сеть кластера следует спроектировать так, чтобы все узлы имели доступ в интернет. Это нужно для большего комфорта при настройке кластера и установки необходимого программного обеспечения на его узлах. Дело в том, что установка ПО в Ubuntu выполняется посредством закачки новейших версий необходимых пакетов из внешних репозиториев. В действительности достаточно будет обеспечить выходом в Интернет только главный компьютер (консоль кластера) , а для вычислительных узлов необходима только возможность загружать программные пакеты через прокси. Осуществить это можно, установив на консоли кластера пакет apt-cacher-ng, а на вычислительных узлах сконфигурировать менеджер пакетов apt-get для работы через прокси. Для этого на консоли кластера выполним команду:
sudo apt-get install apt-cacher-ng
После этого на всех остальных узлах выполним команды:
sudo sh -c "echo "Acquire::http { Proxy " ссылка"; }; "> /etc/apt/apt.conf.d/01proxy"
sudo apt-get update
Здесь мы предполагаем, что адрес 192.168.1.1 - это адрес консоли кластера во внутренней сети кластера.
После установки базовой операционной системы необходимо доустановить необходимое для функциониования кластера по: компиляторы, библиотеки и программы OpenMPI, SSH, NFS. Выполнить это можно с помощью следующих команд:
sudo apt-get install mc build-essential fort77 gfortran libstdc++5 libltdl7-dev
sudo apt-get install openssh-server nfs-kernel-server
sudo apt-get install openmpi-bin openmpi-doc
Данная последовательность команд устанавливает в систему OpenMPI и компиляторы из набора Gnu Compiller Collection (gcc). Компиляторы gcc обладают одним существенным (в некоторых случаях) недостатком. В них нет поддержки работы с типами данных REAL*16 и COMPLEX*32 (в терминологии Фортрана) . Если для ваших задач необходима такая точность вычислений, то вы вместо стандартного набора компиляторов и пакета OpenMPI из состава дистрибутива должны будете установить компиляторы фирмы Intel и скомпилировать OpenMPI с поддержкой этих компиляторов. Как это сделать - рассказано в следующих двух параграфах этой статьи. Если же точность REAL*8 и COMPLEX*16 вас устраивает, то следующие два параграфа вы можете пропустить.
ВАЖНО! Если вы решили использовать компиляторы фирмы Intel, то не следует устанавливать OpenMPI из состава дистрибутива. То есть команду sudo apt-get install openmpi-bin openmpi-doc (см. выше) выполнять не следует.